另外，日本北里大学和名古屋大学的研究小组最近也宣布，它们的研究人员已经在纳米水平上对人和果蝇等63种生物进行了研究和分析，并在此基础上绘制成了大约52.26万个蛋白质的立体结构预测模型。
近日又有报道说，这一研究成果现在已经开始用于研究艾滋病病毒对药物产生抗药性的抗药机制。前不久，日本文部科学省还决定从2002年4月开始实施一项名为“蛋白质3000”的大型生命科学研究计划。它的实施目标是，争取在5年之内解析3000种蛋白质的结构与功能，并尽可能多地获得这项研究的专利。日本东京大学科学家加藤茂明最近发现了两种新的蛋白质复合体，这两种物质具有抑制乳腺癌细胞增殖的作用，因此可望被用于新型抗癌药物的开发。这两种蛋白质复合体分别被称为“TRRAP”和“GCN5”，它们是通过抑制细胞功能来抑制癌细胞增殖的，即它们能够阻碍蛋白质与细胞内被称为ER的雌性激素受体结合，因而可以大幅度地抑制癌细胞的增殖。日本神奈川科学技术研究所还揭示出了与白血病有密切关系的“c－Myb”和“c／EBPβ”这两种蛋白质的立体结构及其作用机制。日本横滨市立大学教授绪方一博士指出，这一发现不仅有助于查明正常细胞形成和癌细胞发生的机制，而且它将成为诊断和治疗癌症的新线索。蛋白质是脑细胞的主要成分之一，约占脑重量的35％，在人的记忆、语言、思维、神经传导等方面发挥着重要作用。日本大阪大学远山正弥教授最近发现，一种名为“PS2”的蛋白质能引发老年性痴呆症，这一发现为进一步开发出新的治疗老年性痴呆症药物提供了可能。
美国科学家新近研究发现，俗称早老性痴呆症的阿尔茨海默氏症有朝一日也许能通过验血得到早期发现和诊断。根据此前研究证实，在患者出现痴呆症状之前的10到20年，大脑中的贝塔－淀粉蛋白就开始积聚，当这些蛋白积聚到一定程度就会形成蚀斑。有理论认为，正是这些蚀斑损害了患者脑细胞，导致大脑功能衰退，并引发其他症状。美国国家卫生研究所和日本物理化学研究所的研究小组还发现了一种与大脑记忆有关且有控制食欲作用的蛋白质。这种被称作“蕈毒碱性受体”的蛋白质，除了具有减肥效果外，还有助于查明引起过食症的病理机制，进而为研究出治疗过食症的方法开辟了道路。研究人员山田对此指出：“如果开发出能够抑制这种蛋白质作用的药品，那么过食症就可以得到有效的治疗。”日本东京大学药学系新井洋由教授最近发现了能促进胆固醇合成的蛋白质“SPF”。研究人员将制造SPF的基因植入经过培养的肝细胞内，结果发现肝细胞内胆固醇的合成量升高了20倍以上。据认为，如果进一步开发出能抑制SPF蛋白质制造胆固醇机能的药物，将给高血脂症患者带来福音。基因的主要功能是通过其表达产物———蛋白质来实现的，而蛋白质在合成之后，又具有它们相对独立的修饰、转运和相互间的作用能力，同时还具有对外界因素发生反应的能力。
日本现在已把人工合成蛋白质的研究作为政府蛋白质科研计划的重要组成部分，日本的一些大学和机构在这方面的研究也不断有新成果问世。日本大阪大学中村敏一和松本邦夫两位教授最近成功地合成出能阻止癌细胞扩散的名为“NK4”的蛋白质。经过在动物体内试验证实，这种蛋白质对胰腺癌、肺癌、乳腺癌和胆囊癌四种癌症很有疗效。松本教授说，许多癌细胞都能攻击人体内分布很广的纤维母细胞，使之释放出肝细胞增殖因子（HGF）。这种因子与癌细胞表面的受体结合后，癌细胞就会向周围组织进行扩散。两位教授解析了肝细胞增殖因子的结构后合成出了“NK4”。试验结果表明，“NK4”能作用于癌细胞的受体，使之无法与肝细胞增殖因子结合，因而防止了癌细胞向正常组织扩散。日本角弘公司最近发表报告说，公司研究人员已经从大马哈鱼的鼻软骨中提取出了用途广泛的高纯度蛋白多糖。蛋白多糖是由蛋白质和葡萄糖胺聚糖构成，存在于动物的关节软骨中，起关节润滑剂的作用。研究人员将50条大马哈鱼的鼻软骨粉碎、脱脂、干燥，再去除骨胶原，结果从中提取出了约1.4克蛋白多糖。
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